Башкармалыктын негизги милдеттери болуп төмөнкүлөр саналат:
- муниципалдык билим берүү уюмдарынын тармагын жана билим алуу үчүн жарандардын укуктарын камсыз кылуу;
- жаштарды кесиптик даярдоо маселелерин координациялоо;
- чарбалык тейлөөнү жана ведомство алдындагы билим берүү уюмдарын каржылоону жүргүзүү;
- окуу-тарбия процессин өнүктүрүүгө багытталган программаларды ишке ашыруу, коомдун билим берүүчүлүк жана интеллектуалдык дараметин түзүү жана жогорулатуу;
- мектепке чейинки, мектеп жана мектептен тышкары билим берүүнүн деңгээлдерин камтыган үзгүлтүксүз билим берүүнүн тутумунун тармагын рационализациялоо жана өнүктүрүү;
- Кыргыз Республикасынын мыйзамдарында каралган мамлекеттик талаптарды эске алуу менен ата мекендик жана чет өлкөлүк педагогикалык илим жана практиканын акыркы жетишкендиктеринин негизинде окутуунун усулдарын жана формаларын иштеп чыгуу жана өркүндөтүү;
- балдар жана өспүрүмдөр үчүн билим берүүнүн жеткиликтүүлүгү боюнча камсыз кылуу жана контролдоо;
- муниципалдык райондук билим берүү борборлорунун жана мектепке чейинки, мектеп жана мектептен тышкары билим берүү уюмдарынын окуу-усулдук жана маалымат-укуктук ишмердигин камсыз кылуу;
- билим берүү маселелерин ишке ашырууга багытталган, аймактык программаларды жана долбоорлорду финансылык колдоо үчүн инвестицияларды жана гранттарды тартуу;
- муниципалдык билим берүү уюмдарынын ишинин мониторинги.