В целях формирования эффективной структуры центрального аппарата мэрии города Бишкек и проведения реорганизации была создана соответствующая рабочая группа по проведению анализа деятельности аппарата.

В ходе работы группы были изучены и рассмотрены положения об отделах аппарата, проведен функциональный анализ обязанностей сотрудников и мониторинг выполняемых их задач и полномочий.

Анализ показал, что структура центрального аппарата мэрии города Бишкек, действующая на основе отраслевой направленности, не в полной мере оправдывает себя, в результате чего сотрудники аппарата, зачастую ведут деятельность и исполняют работу подведомственных подразделений мэрии города Бишкек, что не оставляло времени на реализацию одной из основных компетенций мэрии - организацию безукоризненного функционирования и развития системы жизнеобеспечения столицы. В результате чего задачи и функции, возложенные на сотрудников, остаются до конца не реализованными. 

По результатам проведенного анализа деятельности центрального аппарата мэрии города Бишкек рабочая группа пришла к мнению, что с целью повышения эффективности исполнения возложенных задач и функций необходимо изменить ныне действующую структуру и перейти от отраслевого принципа к функциональному.

Новая структура сфокусирована на совершенствовании административного управления как основном двигателе процесса планирования, организации, мотивации и контроля над работой всей системы мэрии. Совершенствование управления повысит качество формируемой политики, а освобождение сотрудников аппарата от выполнения не свойственных задач и функций позволит усилить контроль за деятельностью подведомственных подразделений мэрии и выполнения ими работы в соответствии с возложенными задачами, функциями, полномочиями и должном объёме.

В связи с чем, утверждена новая структура центрального аппарата мэрии города Бишкек, которая включает в себя:

- управление по подготовке решений, 

- управление организационно-контрольной работы, 

- управление политики развития города.

- отделы международного сотрудничества и протокола, противодействия коррупции и взаимодействия с правоохранительными органами, внутреннего аудита, информационного и документационного обеспечения.

В составе Управления по подготовке решений созданы отдел экспертизы и подготовки решений, отдел муниципального управления и человеческих ресурсов, отдел правовой работы. Основными задачами управления являются обеспечение подготовки проектов нормативных правовых актов, постановлений и распоряжений мэрии, обеспечение их соответствия основным стратегическим и иным программным документам по вопросам разработки и реализации политики во всех сферах развития городского хозяйства, правовое и кадровое обеспечение реализации полномочий мэра.

В составе управления организационно-контрольной работы созданы отдел организационной работы, отдел контроля исполнения решений, в структуре которого утверждены сектор по работе с обращениями граждан и сектор документационного контроля. Основными задачами управления являются обеспечение деятельности руководства мэрии по вопросам контроля и оценки уровня соблюдения исполнительской дисциплины аппарата, подразделений мэрии и их должностных лиц, осуществление мониторинга и анализа общего состояния дел в районах города, координация и мониторинг деятельности аппаратов муниципальных администраций мэрии города Бишкек по административным районам, муниципальных территориальных управлений по вопросам, обеспечение надлежащего рассмотрения обращений граждан.

В составе управления политики развития города созданы отдел стратегического развития и привлечения инвестиций, отдел отраслевого развития, отдел развития социальной сферы и государственного языка. Основными задачами управления являются информационно-аналитическое и организационное обеспечение деятельности мэрии по вопросам разработки и реализации политики стратегического развития города Бишкек, определение приоритетных направлений инновационного развития города, разработка и обеспечение реализации программы социально-экономического развития города, привлечение инвестиций и грантов в экономику города Бишкек.